Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plod3Q9R0E1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms