Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Wdr54Q9R0D8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Wdr54Q9R0D8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Wdr54Q9R0D8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Wdr54Q9R0D8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Wdr54Q9R0D8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Wdr54Q9R0D8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Wdr54Q9R0D8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Wdr54Q9R0D8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Wdr54Q9R0D8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Wdr54Q9R0D8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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