Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp11cQ9QZW0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp11cQ9QZW0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms