Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphs1Q9QZS7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphs1Q9QZS7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphs1Q9QZS7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nphs1Q9QZS7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nphs1Q9QZS7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nphs1Q9QZS7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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