Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms