Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp21Q9QZL6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms