Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ercc4Q9QZD4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ercc4Q9QZD4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms