Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnnt3Q9QZ47 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms