Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phtf1Q9QZ09 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phtf1Q9QZ09 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms