Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx4Q9QY61 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms