Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cpsf3Q9QXK7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms