Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limd1Q9QXD8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Limd1Q9QXD8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms