Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc2lQ9JME7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms