Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap3b2Q9JME5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap3b2Q9JME5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms