Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp1Q9JLK7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms