Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd2l2Q9JLG4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms