Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tlr5Q9JLF7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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