Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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CubnQ9JLB4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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