Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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CtsmQ9JL96 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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CtsmQ9JL96 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsmQ9JL96 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtsmQ9JL96 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms