Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bace2Q9JL18 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms