Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scamp4Q9JKV5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms