Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacng3Q9JJV5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms