Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng4Q9JJV4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms