Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc86Q9JJ89 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc86Q9JJ89 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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