Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lmbr1Q9JIT0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms