Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA9

Ctsr, Cathepsin R, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsrQ9JIA9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtsrQ9JIA9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsrQ9JIA9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms