Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pus3Q9JI38 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pus3Q9JI38 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms