Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms