Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp6Q9ESX2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms