Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Dap3Q9ER88 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms