Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Barx1Q9ER42 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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