Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bap18Q9DCT6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms