Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chmp2aQ9DB34 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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