Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39lQ9DB16 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cab39lQ9DB16 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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