Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Cnn3Q9DAW9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms