Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ift43Q9DA69 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms