Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tmem239Q9DA47 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tmem239Q9DA47 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tmem239Q9DA47 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tmem239Q9DA47 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Tmem239Q9DA47 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Tmem239Q9DA47 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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