Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sgf29Q9DA08 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sgf29Q9DA08 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms