Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700123K08RikQ9D991 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700123K08RikQ9D991 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms