Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot8Q9D8X5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms