Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arfgap3Q9D8S3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms