Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl4Q9D8E6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms