Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifi35Q9D8C4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifi35Q9D8C4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms