Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Jam3Q9D8B7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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