Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms