Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4cQ9D7F7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms