Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q9D7E4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q9D7E4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms