Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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