Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc3Q9D6Y1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc3Q9D6Y1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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