Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4aQ9D6F9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms